近日，中山大學(xué)有害生物控制與資源利用國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室曹永長(zhǎng)教授團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)了一種能夠引起仔豬腹瀉，對(duì)新生仔豬具有高致死性，對(duì)生產(chǎn)造成嚴(yán)重危害的新的冠狀病毒。相關(guān)研究成果于2017年6月27日以“A New Bat-HKU2–like Coronavirus in Swine, China, 2017”為題在國(guó)際傳染病領(lǐng)域權(quán)威期刊《新發(fā)傳染病》(Emerging Infectious Diseases)上在線發(fā)表。
2010年入冬以來(lái)，豬流行性腹瀉病毒(PEDV)變異株開(kāi)始在我國(guó)流行，并導(dǎo)致全國(guó)范圍內(nèi)的嚴(yán)重爆發(fā)，初生仔豬感染后死亡率達(dá)90%以上; 隨后，可導(dǎo)致仔豬腹瀉的新型腸道冠狀病毒Delta冠狀病毒(PDCoV)也被發(fā)現(xiàn)；冠狀病毒的高變異特性目前已經(jīng)成為仔豬腹瀉防控的難點(diǎn)，給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大經(jīng)濟(jì)損失，對(duì)養(yǎng)豬業(yè)的發(fā)展形成嚴(yán)重威脅。
2017年初開(kāi)始，廣東部分豬場(chǎng)先后暴發(fā)免疫豬群新生仔豬腹瀉、死亡的案例，臨床發(fā)病比PEDV稍晚、死亡率稍低，實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)排除了常見(jiàn)的幾種豬腹瀉相關(guān)病毒感染。為快速診斷該疫情的確切病原，曹永長(zhǎng)教授團(tuán)隊(duì)利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)死亡仔豬小腸內(nèi)容物進(jìn)行檢測(cè)，發(fā)現(xiàn)了一種新的冠狀病毒，將其命名為豬腸道α冠狀病毒(porcine enteric alphacoronavirus, PEAV)。全基因組序列分析顯示PEAV與來(lái)源于蝙蝠的HKU2同源性高達(dá)95%，其中纖突蛋白的差異性較大。兩種病毒的纖突蛋白核苷酸和氨基酸相似性分別只有80%和87%，這很可能是PEAV能夠在豬群中傳播的關(guān)鍵。通過(guò)比較7個(gè)保守的關(guān)鍵復(fù)制酶的氨基酸序列相似性，確定PEAV與HKU2在病毒學(xué)分類(lèi)中屬于同一種病毒。
中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院博士生龔浪和博士后李杰為論文的共同第一作者，廣東溫氏食品集團(tuán)股份有限公司溫志芬高級(jí)畜牧師和中山大學(xué)曹永長(zhǎng)教授為論文共同通訊作者。該研究得到了國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃的支持。
原文摘要：
We identified from suckling piglets with diarrhea in China a new bat-HKU2–like porcine coronavirus (porcine enteric alphacoronavirus). The GDS04 strain of this coronavirus shares high aa identities (>90%) with the reported bat-HKU2 strains in Coronaviridae-wide conserved domains, suggesting that the GDS04 strain belongs to the same species as HKU2
